亲子鉴定是如何鉴定亲子关系的?我们都知道人身体里面的血液，毛孔，头发等等几乎所有东西都包含DNA，而且每个人的DNA都各不相同。以基因点D8S1179为例，母亲提供小孩1 5的基因半型，故生父必须具备11的基因半型，假设父一(14和16)并不具备，而假设父二(1 1和14)在此位点则不能排除。在所有检验基因位点中，假设父一：已有3 组以上不符时，即可直接排除与小孩之亲子关係;假设父二：则由鉴定结果来计算与小孩间的亲子关系机率。
那到底要鉴定几组基因位点才够呢?或者亲子鉴定要确定亲子关系的准确率是多少?鉴定愈多组将可获得愈高的亲子关系确定率!美国联邦调查局的标准是至少鉴定13组以上。而我鉴定中心是检验21组STR基因位点与2组血型(ABO+RH)，必要时再加以检测HLA typ in g系统以资辅助。其中21组基因位点中，2个没有血缘关系的人要得到完全相同的基因半型机率约为60亿分之一，故鉴定的错误率几乎不存在。
人的血液、毛发、唾液、口腔细胞及骨头等都可用于亲子鉴定。每个人体细胞有23对(46条)成对染色体，同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。利用DNA进行亲子鉴定，只要做十几至几十个DNA位点检测，如果全部一样，就可以确定亲子关系，如果有3个以上的位点不同，则可排除亲子关系。DNA亲子鉴定，对亲子关系的准确率可达到99.9999%。这就是DNA亲子鉴定的实验原理。
目前各大医院和亲子鉴定中心均以检验DNA短片段重复序列为主，最新的DNA检验系(PCRamplified STR)约可达到99.99%以上的排除率。正常人有23对染色体，染色体上带有遗传密码基因，而染色体一半来自妈妈，另一半来自爸爸。亲子鉴定就是将小孩、母亲与假设父亲同时进行多组基因位点的鉴定来鉴定亲子关系的。
